Shannondiversiteitsindex

De Shannondiversiteitsindex, ook bekend als de Shannon-Weaver index, is een maat voor de diversiteit van een soortgemeenschap. De index combineert informatie over het aantal verschillende soorten (rijkdom) met de verdeling van individuen over die soorten (evenwicht). De index wordt berekend met H' = −∑ p_i ln(p_i), waarbij p_i de relatieve abundantie van soort i is (aantal individuen van soort i gedeeld door het totale aantal individuen). De natuurlijke log wordt meestal gebruikt; soms wordt een andere basis toegepast en de waarde verandert daardoor van eenheden.

Het maximale H' voor een gemeenschap met S soorten is ln(S). Dit treedt op wanneer alle soorten even vaak voorkomen (p_i = 1/S). Een gerelateerde maat is de evenness E = H'/ln(S), die aangeeft hoe gelijkmatig de abundantie verdeeld is.

Toepassingen: de Shannonindex wordt veel gebruikt in ecologie en microbiologie om de diversiteit van ecosystemen, habitats of microbiële gemeenschappen te vergelijken. Voorbeelden zijn studies van bos- en landbouwsystemen, bodems, rivieren en menselijke microbiomen.

Berekening en interpretatie: doorgaans worden monsters verzameld en geteld per soort. H' geeft een samenvatting van diversiteit; hogere waarden betekenen hogere diversiteit, maar vergelijkingen vereisen vergelijkbare steekproeven en methoden. Beperkingen: de index is gevoelig voor de steekproefomvang en detectie van zeldzame soorten; hij geeft geen informatie over functionele diversiteit of fylogenetische verwantschappen en kan misleidend zijn bij sterk ongelijke verdelingen.