RNAfragmenttien
RNAfragmenttien are korte stukken RNA die ontstaan door cleavage, afbraak of verwerking van grotere RNA-moleculen. Ze kunnen van enkele nucleotiden tot enkele honderden nucleotiden lang zijn en ontstaan zowel in vivo door cellulaire enzymatische activiteiten als in vitro tijdens experimentele sample preparation. In cellen wordt RNA afgebroken door verschillende RNases en tijdens de verwerking van rRNA, tRNA en mRNA ontstaan ook fragmenten. Sommige fragmenten hebben een regulerende functie, zoals tRNA-gerelateerde fragmenten (tRFs) of snoRNA-afgeleide fragmenten, terwijl veel langere fragmenten simpelweg als afbraakproducten kunnen worden beschouwd.
In de genomica en moleculaire biologie spelen RNAfragmenten een dubbele rol. Ze kunnen als onderzoeksobject dienen
Externe of circulerende RNAfragmenten (exRNA) worden aangetroffen in biofluïden zoals bloed, speeksel en urine en zijn
Analytische benaderingen omvatten Northern blot, RT-qPCR, en zowel total-RNA- als small RNA-sequencing. Kwaliteitsbeoordeling van RNA-integriteit houdt