Eiwitmassa

Eiwitmassa is de massa van een eiwitmolecuul, uitgedrukt in dalton (Da) of kilodalton (kDa). Het geeft aan hoe zwaar een eiwit is op moleculair niveau en vormt een basiskenmerk bij identificatie, structuur en functie. Bij eiwitcomplexen verwijst men naar de totale massa van het complex, terwijl de massa van afzonderlijke subunits vaak apart wordt gerapporteerd.

Theoretische massa: berekening uit de aminozuurvolgorde. De theoretische moleculaire massa wordt berekend door de som van de molaire massa's van alle aminozuren in de sequentie, plus eventuele correcties voor verwijdering of toevoeging van onderdelen zoals signaalpeptides, initiële methionine of verwijderde propeptides. Werkelijke massa kan verschillen door post-translationele modificaties (bijv. fosforylatie, glycosylering) of proteolyse, en door verschillende isoforms.

Meetmethoden: Massaspectrometrie (bijv. MALDI-TOF, ESI-MS) kan de exacte massa van een intact eiwit bepalen. Daarnaast geven gel-filtratie (size-exclusion chromatography) en SDS-PAGE schattingen van de moleculaire massa op basis van migratie of elutie, maar deze methoden zijn minder precies en kunnen variëren met condities en conformatie.

Toepassingen en overwegingen: Massa-informatie helpt bij identificatie, het onderscheiden van isoforms en bij het plannen van experimenteel ontwerp in chromatografie en kristallografie. Eiwitmassa kan variëren tussen organismen, cellulaire toestand en door post-translationele modificaties; heterogeniteit zoals glycosylatie of fosforylatie kan de interpretatie bemoeilijken.

Zie ook: moleculaire massa, post-translationele modificatie, massaspectrometrie.