genenrijke

Een genenrijke regio is een gebied in het genoom waar een relatief hoog aantal genen per megabase voorkomt. In genomische annotatie wordt vaak onderscheid gemaakt tussen genenrijke en genenarme regio's. Genenrijke regio's bevatten doorgaans een groter aantal proteïne-coderende genen, kortere intergenische afstanden en vaker aanwezige exon-structuren. De aanwezigheid van deze regio's weerspiegelt de verdeling van genen over het genoom en heeft implicaties voor regulatie en evolutie.

Kenmerken en locaties: genenrijke regio's komen vaker voor in euchromatine, zijn vaak GC-rijker en bevatten doorgaans CpG-eilanden die geassocieerd zijn met promotorelementen. Ze vertonen vaak hogere genexpressie in meerdere weefsels en hebben vaker recombinatie-activiteit, hoewel dit per soort kan variëren. Ze kunnen clusters vormen van functioneel gerelateerde genen of genfamilies die door duplicatie zijn uitgebreid.

Relatie met genedeserts: tegenover genenrijke regio's staan genenarme regio's, ook wel genedeserts genoemd, met grote intergenische afstanden en weinig coderend DNA. De variatie in genendichtheid draagt bij aan de organisatie van het genoom en aan de evolutie van regulatoire netwerken.

Onderzoek en toepassingen: wetenschappers gebruiken kaarten van genendichtheid en annotatie van genen, evenals vergelijkende genomica, om genenrijke regio's te identificeren. Kennis van genenrijke regio's kan informatie opleveren over functionele modules, genetische regulatie en evolutionaire conservatie.