K63gecodeerde

K63gecodeerde verwijst naar een type ubiquitinatie waarbij polyubiquitineketens worden opgebouwd via koppelingen die door lysine 63 (K63) van ubiquitine zijn gevormd. In tegenstelling tot K48-gekoppelde ketens, die meestal eiwitten bestempelen voor afbraak door het proteasoom, opereren K63-gekoppelde ketens als signaal- of platformstructuren die vele niet-degradatieve cellulaire processen coördineren. Deze modi treden op als scaffolds die interacties tussen eiwitten vergemakkelijken en zo verschillende signalingroutes activeren of moduleren.

De synthese en verwijdering van K63gecodeerde ketens verlopen via specifieke enzymatische stappen. UBE2N (ook bekend als Ubc13) werkt vaak samen met een tweede E2-enzym zoals UEV1A om K63-gekoppelde ketens op te bouwen, ondersteund door E3 ligases die gericht zijn op signaleringsprocessen zoals NF-κB-activatie en DNA-schadeherstel. De-remmers of verwijdering van K63ketens wordt uitgevoerd door deubiquitinase-enzymen (DUBs), die ketens kunnen afbreken en zo signalen kunnen uitschakelen of finetunen. De exacte combinaties van E2, E3 en DUBs variëren per celtype en stimuli.

Belangrijke biologische rollen van K63gecodeerde ubiquitinatie omvatten DNA-schaderespons, regulatie van inflammatoire en immuunsignalen, endocytose en receptortrafficking, evenals autophagie- en signaalbrugfuncties. Dysregulatie van K63gecodeerde ubiquitinatie is in verband gebracht met ziekten zoals kanker, auto-immuniteit en neurodegeneratieve aandoeningen, waardoor het onderwerp van fundamenteel onderzoek en therapeutische overwegingen blijft. Detectie en studie maken gebruik van linkage-specifieke antilichamen, massaspectrometrie en genetische benaderingen.