promotorconsenussequenties
Promotorconsenussequenties verwijzen naar de meest voorkomende nucleotidepatronen in promotorregio’s, de DNA-sequenties die de start van transcriptie bepalen. Ze vormen een motief dat vaak wordt weergegeven als een consensus of als een positionele gewichtsmaat (PWM) en wordt herkend door RNA-polymerase en bijbehorende transcriptiefactoren. Door deze patronen te analyseren kunnen onderzoekers promotorregio’s voorspellen en regulatiepatronen beter begrijpen.
In bacteriën bestaan promotoren typisch uit core-elementen nabij het transcripte startpunt: een -35-element en een -10-element,
In eukaryoten en archaea zijn promotorconsenussequenties diverser. Een kenmerk is de TATA-box, meestal rond -25, met
Consensussequenties zijn probabilistische patronen; ze worden vaak geïllustreerd met sequence logos en weergegeven als PWM’s. Veel
Toepassingen omvatten bioinformatica voor promotorpredictie, motifontdekking (bijv. MEME) en experimentele validatie via primer extension, 5’-RACE en