transcriptómicos

La transcriptómica es la disciplina de la biología molecular que se dedica al estudio del transcriptoma, el conjunto completo de transcripciones de ARN producidas por el genoma en una célula, tejido o condición experimental determinada. Incluye mensajeros (ARNm), ARN no codificantes y transcritos derivados de procesamiento alternativo.

Las tecnologías principales han evolucionado desde los microarreglos hasta la secuenciación de ARN (RNA-Seq). Los microarreglos miden la abundancia de transcripciones conocidas mediante hibridación. RNA-Seq, mediante la construcción de bibliotecas de cDNA y su secuenciación, cuantifica transcripciones de forma más amplia, detecta nuevos transcritos y estudia isoformas. El campo se está expandiendo con la transcriptómica de células individuales para analizar la heterogeneidad celular.

El flujo de trabajo típico incluye extracción de ARN, preparación de bibliotecas, secuenciación, alineamiento a una referencia, ensamblaje de transcritos y cuantificación de expresión. Se realizan normalización y análisis diferencial para identificar genes diferencialmente expresados, junto con análisis de isoformas, enriquecimiento funcional y redes de coexpresión.

Aplicaciones: investigación básica en desarrollo y fisiología, biomedicina para entender mecanismos de enfermedad, biomarcadores y respuestas a fármacos, y comparaciones evolutivas. También favorece la integración con otros dominios omicos para mapear la regulación de la expresión génica.

Entre recursos de datos se encuentran repositorios públicos como GEO y ArrayExpress. Limitaciones: sesgos de muestreo, rango dinámico, resolución de isoformas y dependencia de anotaciones; los análisis requieren control de batch effects y validación experimental.