microarreglos

Los microarreglos, o microarrays, son una tecnología de biología molecular que permite analizar de forma simultánea la expresión de miles de genes, la presencia de variantes o la interacción entre proteínas. Consisten en un soporte sólido, típicamente una lámina de vidrio o un chip, en el que se disponen miles de sondas de ADN, cDNA o proteínas en una matriz ordenada. Cada punto de la matriz, llamado un tipo de “probo” o pulso, contiene una sonda específica que puede hibridar con una molécula objetivo.

El principio de funcionamiento implica etiquetar las muestras de interés con marcadores fluorescentes u otros reportadores y permitir que estas moléculas se hybridicen con las sondas correspondientes en el microarreglo. Tras lavados para eliminar la señal no específica, un escáner detecta la fluorescencia en cada punto, y la intensidad de la señal se interpreta como la abundancia relativa de la molécula diana en la muestra. El análisis de datos suele incluir normalización, corrección de fondo, replicados y pruebas estadísticas para identificar diferencias entre condiciones.

Existen varios tipos de microarreglos. Los microarreglos de ADN se utilizan principalmente para perfilado de expresión génica, genotipado y análisis de variaciones cromosómicas; los microarreglos de proteínas permiten estudiar interacciones, perfiles de antígenos o anticuerpos. Los microarreglos de tejido (tissue microarrays) permiten analizar expresiones proteicas en grandes series de tejidos en una sola experiencia.

Ventajas y limitaciones: permiten estudiar grandes volúmenes de información de forma relativamente eficiente y con coste menor en comparación con métodos secuenciales, pero requieren material de alta calidad, pueden sufrir de hibridación cruzada, tienen un rango dinámico limitado y demandan complejos procesos de normalización y validación. En la actualidad, la secuenciación de nueva generación (RNA-Seq) ha completado gran parte de su función, aunque los microarreglos siguen utilizándose en ciertas aplicaciones diagnósticas y de investigación.