DecoySequenzen
DecoySequenzen, auch als Decoy-Sequenzen bezeichnet, sind künstlich erzeugte DNA- oder RNA-Sequenzen, die in Sequenzierungs-Experimenten eingeführt oder in Referenzdaten aufgenommen werden. Sie dienen als bekannte Negativbeispiele, um Kontrollen zu ermöglichen, Qualitätsmetriken zu gewinnen und Fehlzuordnungen oder Artefakte wie Kontamination, Index-Hopping oder falsch zugeordnete Reads zu identifizieren.
Eigenschaften und design: Decoy-Sequenzen werden so konstruiert, dass sie keine signifikante Homologie zum Genom oder Transkriptom
Anwendung: In der Bioinformatik werden DecoySequenzen verwendet, um Reads zu identifizieren, die eindeutig auf Decoys abgebildet
Vorteile und Limitationen: Der Einsatz von DecoySequenzen kann die Zuverlässigkeit von Interpretationen verbessern, erhöht jedoch die
Siehe auch: Spike-in-Kontrollen, Synthetic controls, Decoy genome, Qualitätskontrollen.