RNASequenzen
RNASequenzen bezeichnet die Abfolge von Nukleotiden in Ribonukleinsäure (RNA). Eine RNA-Sequenz besteht aus den vier Basen Adenin (A), Cytosin (C), Guanin (G) und Uracil (U). RNAs sind typischerweise einzelsträngig, können aber durch Basenpaarung Faltungen und sekundäre Strukturen ausbilden. Die Sequenz bestimmt Funktion und Interaktionen von RNA-Molekülen.
RNA-Transkripte umfassen verschiedene Typen: messenger RNA (mRNA), transfer RNA (tRNA), ribosomale RNA (rRNA) sowie regulative RNAs
Bestimmung von RNA-Sequenzen erfolgt durch Sequenzierungstechnologien. Die gängigste Methode ist die RNA-Sequenzierung (RNA-Seq), bei der RNA
Aus Rohdaten werden Reads an Referenzgenomen oder -transkripten ausgerichtet, Transkripte referenziert oder de novo zusammengesetzt. Typische
Anwendungen reichen von Genexpressionsprofilen und Entdeckung neuartiger Transkripte bis hin zu Vergleichen zwischen Spezies. Herausforderungen umfassen