värdbakterier
Värdbakterier är bakterier som lever i eller på en värd och bildar en ecosystem i samspel med värden. Interaktionerna kan vara commensala (värden påverkas inte av bakterierna), mutualistiska (bakterier ger värden fördelar) eller patogena (bakterier orsakar sjukdom). Värdbakterier finns i olika biotoper, till exempel i människans tarmkanal, hud och slemhinnor, samt hos djur och växter.
Hos människor dominerar tarmens mikrobiota, där bakterier som tillhör phyla Firmicutes och Bacteroidetes deltar i nedbrytning
Värdens försvarsmekanismer, såsom slem, antimikrobiella ämnen och immunreaktioner, påverkar vilka bakterier som kan etablera sig. Bakterierna
Patogena värdbakterier orsakar infektioner via virulensfaktorer som toxiner, sekretionssystem och kapslar och kan spridas genom olika
Forskning om värdbakterier fokuserar på hur mikrobiotan påverkar hälsa och sjukdom, hur den påverkas av kost