antigeenfragmenten

Antigeenfragmenten zijn kleine stukjes van een antigeen die het immuunsysteem kunnen herkennen. Ze ontstaan meestal doordat eiwitten worden afgebroken door proteolytische enzymen in cellen zoals antigeenpresenterende cellen. Deze fragmenten kunnen worden gebonden door MHC-moleculen en aan T-cellen worden gepresenteerd, waardoor een specifieke immuunrespons kan worden opgeten.

Er zijn twee hoofdroutes voor de presentatie van antigeenfragmenten: MHC klasse I en MHC klasse II. MHC I presenteert meestal intracellulaire eiwitafbraak aan CD8+ T-cellen, terwijl MHC II exogeen of endocytoseerde fragmenten aanbiedt aan CD4+ T-cellen. Daarnaast kunnen B-cellen antigeenfragmenten herkennen via hun B-cell receptors en zo antistoffen produceren.

Epitoepen zijn de delen van een antigeen die door het immuunsysteem worden herkend. Epitoepen kunnen lineair zijn, bestaande uit opeenvolgende aminozuurresiduen, of conformational door de drie-dimensionale structuur van het antigeen afhankelijk zijn. Het identificeren van relevante epitopen is belangrijk voor vaccinontwikkeling en diagnostiek.

Toepassingen van antigeenfragmenten omvatten epitope mapping, peptide-gebaseerde vaccins en diagnostische assays. Onderzoeksmethoden omvatten het gebruik van synthetische peptiden en massaspectrometrie om specifieke fragmenten te identificeren en hun immuunrespons te evalueren.