Patogenidentifikation

Patogenidentifikation ist der Prozess, durch den der verursachende Erreger einer Infektion oder Kontamination eindeutig bestimmt wird. Ziel ist es, den spezifischen Erreger zu identifizieren, seine Eigenschaften zu charakterisieren und damit Diagnose, Therapie und Prävention zu unterstützen. Sie erfolgt in der Regel aus Proben von Patienten, Lebensmitteln, Wasser oder der Umwelt.

Zu den gebräuchlichsten Methoden gehören kulturbasierte Identifikation, serologische Tests sowie molekulare Techniken wie PCR, Real-Time PCR und Sequenzierung. MALDI-TOF-Massenspektrometrie dient der schnellen Artbestimmung. Zunehmend kommen metagenomische Ansätze und Next-Generation Sequencing zum Einsatz, um Erreger direkt in Proben zu identifizieren oder seltene Erreger aufzuspüren. Schnelltests an der Schnittstelle Klinik-Labor werden ebenfalls verwendet.

Ablauf in vielen Laboren: Probenentnahme und sichere Aufbereitung, initiales Screening, Bestätigung der Art durch spezifische Tests, ggf. Antibiotikaempfindlichkeits- bzw. Resistenztests, Befunddokumentation und Meldung an Ärzte und Gesundheitsbehörden. Die Ergebnisse beeinflussen Therapieentscheidungen, Infektionskontrollen und epidemiologische Maßnahmen.

Anwendungsgebiete umfassen klinische Diagnostik, Ausbruchsuntersuchungen, Infektionskontrolle in Einrichtungen, Lebensmittelsicherheit und Wasserüberwachung sowie Umwelt- und Biowarnsysteme. Qualitätskontrollen, Standardisierung und regulatorische Vorgaben sind essenziell.

Herausforderungen umfassen Geschwindigkeit, Sensitivität, Kreuzreaktionen, Kontaminationen und die Interpretation komplexer Sequenzdaten. Die Integration von Resistenzinformationen und Epidemiologie erfordert interdisziplinäre Zusammenarbeit und gut gepflegte Datenbanken.

Fortschritte umfassen schnelle Sequenzierung, portable Diagnostikgeräte, automatisierte Auswertungen und offene Sequenzdatenbanken, die den Informationsaustausch verbessern.