Kopienzahländerungen

Kopienzahländerungen sind Unterschiede in der Anzahl von Kopien bestimmter DNA-Abschnitte im Genom im Vergleich zur Referenz. Sie umfassen Deletionen (Verlust von Kopien) und Duplikationen (zusätzliche Kopien) und können von wenigen Kilobasen bis zu mehreren Megabasen groß sein. Kopienzahländerungen können in Keimbahnzellen (germline) oder somatisch auftreten und tragen zur genetischen Variation bei, können aber auch krankheitsverursachend sein.

Herkunft und Merkmale: Die Entstehung erfolgt durch fehlerhafte Rekombination oder Replikationsprozesse, zum Beispiel durch nicht-äquimolekulare Homologerekombination (NAHR) oder FoSTeS/Mosaic-Mechanismen. Regionen mit repetitiven Sequenzen oder niedriger Sequenzhomologie begünstigen wiederholte Kopienveränderungen. Die Größenordnung reicht typischerweise von Kilobasen bis Megabasen. Viele CNVs sind harmlos oder typisch für bestimmte Populationen, während andere dosage-sensitive Gene betreffen und Krankheiten verursachen können.

Klinische Relevanz: In der Humangenetik sind CNVs mit Entwicklungsstörungen, Mikro-/Makrodysbalancen und neuropsychiatrischen Erkrankungen assoziiert. Somatische CNVs spielen eine zentrale Rolle in der Krebsgenetik, indem sie Onkogene amplifizieren oder Tumorsuppressorgene löschen. MosaicismusCNVs können Gewebe unterschiedlich betreffen und diagnostische Herausforderungen darstellen. Die Interpretation erfordert Kontext zu Vererbung, Größe, betroffenen Genen und Phänotyp.

Nachweis und Interpretation: Techniken wie array-CGH, SNP-Arrays und sequencing-basierte Ansätze erkennen Kopienzahlveränderungen; FISH oder qPCR dienen der Validierung. Die Bewertung erfolgt nach Kriterien, z. B. pathogenic, likely pathogenic oder VUS, oft nach Richtlinien von Fachgesellschaften. Datenbanken wie DGV, ClinVar oder DECIPHER unterstützen die Beurteilung und Klassifikation.