EinzelzellAnalytik
Einzelzellanalytik bezeichnet die Untersuchung biologischer Merkmale auf der Ebene einzelner Zellen statt ganzer Zellpopulationen. Sie ermöglicht die Erfassung zellulärer Heterogenität, die Verfolgung von Entwicklungs- oder Reifungsprozessen sowie die Identifikation seltener Zelltypen in Geweben oder Krankheiten.
Zu den zentralen Ansätzen gehören single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), das Transkriptome einzelner Zellen profiliert; single-cell DNA-Sequencing;
Die Auswertung umfasst Qualitätskontrolle, Normalisierung, Clustering zur Identifikation von Zelltypen, Marker-Analysen, Differentialexpression sowie Trajektorien- oder Pseudotime-Analysen,
Anwendungsfelder sind Immunologie, Krebsforschung, Entwicklungsbiologie, Neurowissenschaften sowie Gewebe- und Organentwicklung. In der Krebsforschung dient die Einzelzellanalytik
Typische Herausforderungen umfassen technische Ausfälle (Dropout), Rauschen, Batch-Effekte, hohe Kosten und den hohen Rechenbedarf; die Interpretation
Historisch begann die Einzelzellanalytik in den späten 2000er-Jahren mit der Einführung von scRNA-seq; seither hat sich