filogenéticos

La filogenética es la disciplina biológica que estudia las relaciones evolutivas entre organismos o genes, a partir de similitudes y diferencias en características morfológicas, genéticas y moleculares, para reconstruir su historia común. En plural, el término se usa como adjetivo para describir aquello relacionado con estas relaciones: caracteres filogenéticos, análisis filogenéticos y árboles filogenéticos.

Los enfoques filogenéticos combinan datos de morfología, genética y, cada vez más, genómica. Las fuentes incluyen rasgos morfológicos, secuencias de ADN o proteínas y, a menudo, datos de genomas completos. La inferencia de relaciones se realiza mediante métodos como la parsimonia, la máxima verosimilitud y la inferencia bayesiana, que generan árboles filogenéticos que representan clados y la ascendencia de sus miembros. También se emplean redes para expresar conflictos entre señales evolutivas.

Los árboles filogenéticos permiten clasificar grupos, estimar tiempos de divergencia y estudiar patrones evolutivos como la radiación, la especiación y la coevolución. Su utilidad se extiende a la taxonomía y la systemática, a la biología evolutiva, la medicina y la conservación de la biodiversidad, donde se emplean para comprender la diversidad y las relaciones entre especies, así como para rastrear la evolución de enfermedades.

Entre las limitaciones se encuentran la sensibilidad a la calidad y cantidad de datos, la adecuación de modelos evolutivos y los sesgos causados por la homoplacia, la transferencia horizontal y el muestreo incompleto. Por ello, los resultados filogenéticos suelen acompañarse de medidas de soporte y de análisis de congruencia entre datos diferentes.

Herramientas y software populares incluyen programas para alineamiento, inferencia y visualización de árboles filogenéticos, como MEGA, RAxML, BEAST y MrBayes.