Organismsnivåinformation

Organismsnivåinformation är ett begrepp inom biologi som avser data som kännetecknar en enskild organism snarare än populationer, arter eller ekosystem. Den omfattar genetisk information (genomsekvensering och genuttryck), fenotypiska egenskaper, fysiologiska tillstånd, morfologi, livshistoria och observerat beteende över tid och i olika miljöer. Organismsnivåinformation används för att förstå hur en viss individs egenskaper och funktioner påverkas av genetiska och miljömässiga faktorer.

Insamlingskällor och typer av data inkluderar genom-, transcriptom-, proteom- och metabolomdata; bild- och sensorbaserade mått; fysiska mått såsom vikt och längd; livshastighetsstatus; geografisk plats och tidsinformation; samt beteendebevis som rörelsemönster och födosök. Data samlas in med sekvensering, bildteknik, fältobservationer och wearables eller inbyggda sensorer, ofta i kombination med metadata om miljöförhållanden och uppmätt kontext.

Användningsområden inkluderar individspecifika modeller inom ekologi och medicin, koppling mellan genotyp och fenotyp hos en individ i populationsgenetik, djuravel och bevarandebiologi, samt klinisk personalisering där human organismsnivådata används för behandling. För att möjliggöra jämförbarhet och återanvändning krävs standarder och ontologier för metadata, och etiska överväganden är viktiga när data involverar människor. Organismsnivåinformation utgör därmed en central byggsten i forskning som kräver detaljerad, individcentrerad kunskap.