Endophyten
Endophyten sind Mikroorganismen, die dauerhaft in den Geweben von Pflanzen leben, ohne deren Gesundheit durch Krankheit zu beeinträchtigen. Am häufigsten handelt es sich um Pilze, daneben kommen Bakterien und seltener Archäen vor. Endophytische Pilze finden sich vor allem in Blättern, Stängeln, Wurzeln oder Samen und können von der Mutterpflanze an die Nachkommen übertragen werden.
Endophyten bilden zumeist symbiotische Beziehungen mit ihren Wirten. Sie können die Pflanze vor Schädlingen und Umweltstress
Bei bestimmten pilzlichen Endophyten, insbesondere clavicipitalen Endophyten in Gräsern wie Epichloë/Neotyphodium-Arten, entstehen Alkaloide, die Weidegüter abschrecken
Die Erforschung von Endophyten umfasst kulturbasierte und molekulare Ansätze sowie kulturunabhängige Methoden wie Sequenzierung von Ribosomenregionen