Bakterieanalyser

Bakterieanalyser avser laboratorieprocesser som påvisar, identifierar och karakteriserar bakterier i olika prover. Analysen kan vara kulturbaserad eller kulturfri och syftar ofta till att bestämma närvaro, antal och egenskaper såsom biokemisk profil eller genetik. Resultaten används för diagnostik, övervakning och forskning.

Vanliga metoder inkluderar odling på selektiva och differentiala medier, mikroskopi med färgtekniker, biokemiska tester, MALDI-TOF masspektrometri för snabb identifikation, samt molekylära tekniker som PCR, 16S rRNA-sekvensering och metagenomik. Snabbtester och immunologiska tester används också i vissa sammanhang. Antimikrobiell känslighetstestning följer ofta diskdiffusion eller mikrodilutionsmetoder.

Klinisk diagnostik för infektionssjukdomar, livsmedelssäkerhet och kontroll av livsmedelsproduktion, samt miljöövervakning. Analysen kan också bidra till att följa spridning av resistenta bakterier och övervaka vatten- och avloppskvalitet.

Workflow omfattar provtagning, transport och provberedning, isolering av bakterier och identifikation samt tolkning av resultat och rapportering. Kvalitetsarbete inkluderar kontroller, validering, proficiency testing och standarder såsom CLSI eller EU-referencemetoder samt kvalitetsledning enligt ISO 15189.

Utmaningar inkluderar kontaminering, blandningar av arter, döda celler som påverkar tolkning, samt behov av snabbhet och kostnadseffektivitet. Framtiden fokuserar på molekylbaserade snabbtester, metagenomik och resistensdetektering i realtid.