APOBECperheen

APOBECperheen, eller APOBEC-cytidin-deaminaserna, utgör en familj enzym som katalyserar deaminering av cytidin till uridin i single-stranded DNA eller RNA. Denna kemiska modifiering kan leda till C till T mutationer vid replikation eller till RNA-redigering, beroende på kontext. I människan spelar APOBEC-familjen en viktig roll i immunförsvaret genom att införa mutationer i virus- eller endogena element och därigenom begränsa deras replikation. En särskild del av familjen, AID (activation-induced cytidine deaminase), är central för somatisk hypermutation och klass-switchning i B-celler, vilket möjliggör anpassning av antikroppar.

Familjen omfattar flera ondergrupper, där APOBEC1, APOBEC2 och APOBEC3 samt APOBEC4 ingår. APOBEC3-subfamiljen är särskilt viktig för antiviral försvar och transposonbegränsning, och i människor finns flera parallella gener (till exempel APOBEC3A, B, C, D, F, G och H) som varierar i uttryck och specifika substrat. APOBEC-enzymens funktion är kopplad till deras zinkberoende cytidin deaminas-aktiva site, som har en bevarad katalytisk domän. Några medlemmar verkar främst på RNA (till exempel redigering av mRNA via APOBEC1), medan andra verkar främst på ssDNA under virusreplikation eller vid immunoglobulin-genomiska segment.

Betydelse för hälsa och sjukdom inkluderar deras bidrag till mutationala signaturer som observerats i många cancerformer (APOBEC-signetet). Off-target-aktivering kan orsaka genommutationer i värdens DNA och kopplas till förekomst av kataegis och potentiellt till terapeutisk resistens. Evolutionärt har APOBEC-familjen varit under starkt selektionstryck i möss- och primatlinjer, vilket reflekterar en långvarig kamp mellan värd och virus.