DV200Anteil

DV200Anteil, kurz DV200-Anteil, ist eine Kennzahl aus der Molekularbiologie und Genomik, die den Anteil der DNA-Fragmente angibt, die länger als 200 Basenpaare sind. Er dient als Maß für die Integrität des genetischen Materials, insbesondere bei fragmentierter oder degradierter DNA, wie sie in Formalin-fixed paraffin-embedded Proben (FFPE) oder alten Proben vorkommt.

Messung und Berechnung erfolgen typischerweise durch Fragmentenanalyse (z. B. mit dem Agilent Bioanalyzer oder TapeStation) oder durch die Auswertung von Sequenzierungsdaten. Der DV200-Anteil wird als Prozentsatz der Fragmente über 200 bp am Gesamtfragmentumfang angegeben.

Bedeutung und Anwendung: Der DV200-Anteil unterstützt Entscheidungen zur Bibliotheksvorbereitung in der Next-Generation-Sequencing (NGS) und dient der Qualitätssicherung. Proben mit höherem DV200 liefern tendenziell robustere Ergebnisse bei Standard-NGS-Workflows; niedrige Werte deuten auf deutliche Degradation hin und erfordern eventuell alternative Strategien, wie kurze Insert-Library-Ansätze oder spezielle Kits.

Interpretation und Wertebereich: Werte nahe 100% belegen eine hochwertige DNA, während Werte unter 50% auf beträchtliche Degradation hindeuten. Werte unter 20% gelten als stark degradiert. Die konkrete Einordnung hängt aber von der Probenquelle, der Messmethode und dem geplanten Einsatz ab.

Einschränkungen: DV200 ist eine einzelne Kennzahl und erfasst nicht alle Aspekte der DNA-Qualität, etwa Fragmentlängenverteilung, GC-Gehalt oder chemische Modifikationen. Ergebnisse können plattformabhängig variieren, weshalb DV200-Werte im Kontext anderer Qualitätsmaße betrachtet werden sollten.