Home

proteómica

La proteómica es la disciplina que estudia de forma global el conjunto de proteínas expresadas en un organismo, una célula o un tejido en un estado fisiológico o experimental específico. Su objetivo es identificar, catalogar, cuantificar y comprender las funciones, estructuras, interacciones y modificaciones de las proteínas, así como su variabilidad en diferentes condiciones.

La proteómica se apoya principalmente en la espectrometría de masas (MS), a menudo acoplada a separación cromatográfica

La cuantificación puede ser relativa (p. ej., etiquetas SILAC, iTRAQ o TMT) o absoluta, y permite comparar

Aplicaciones: descubrimiento de biomarcadores, comprensión de mecanismos de enfermedad, identificación de dianas terapéuticas, desarrollo de fármacos,

(LC-MS/MS).
También
se
han
utilizado
técnicas
de
separación
como
la
electroforesis
en
gel
bidimensional,
aunque
la
tendencia
actual
se
orienta
hacia
métodos
basados
en
MS.
El
flujo
de
trabajo
típico
incluye
extracción
de
proteínas,
digestión
proteica
(habitualmente
con
tripsina),
separación,
adquisición
de
espectros
y
análisis
computacional
para
identificar
proteínas
a
partir
de
bases
de
datos
y
para
cuantificarlas.
perfiles
proteómicos
entre
condiciones
diferentes.
El
estudio
de
modificaciones
postraduccionales
(PTMs)
a
gran
escala,
como
fosforilación,
ubiquitinación
o
glycosilación,
es
una
faceta
clave
de
la
proteómica
moderna.
medicina
personalizada,
y
mejoras
en
biotecnología
y
agricultura.
Los
datos
generados
se
comparten
en
repositorios
como
PRIDE
y
proteomeXchange;
herramientas
bioinformáticas
y
redes
de
interacción
(p.
ej.,
STRING,
Cytoscape)
respaldan
el
análisis.
Desafíos:
complejidad
del
proteoma,
rango
dinámico
de
abundancias,
reproducibilidad
y
estandarización
de
métodos.