proteómica

La proteómica es la disciplina que estudia de forma global el conjunto de proteínas expresadas en un organismo, una célula o un tejido en un estado fisiológico o experimental específico. Su objetivo es identificar, catalogar, cuantificar y comprender las funciones, estructuras, interacciones y modificaciones de las proteínas, así como su variabilidad en diferentes condiciones.

La proteómica se apoya principalmente en la espectrometría de masas (MS), a menudo acoplada a separación cromatográfica (LC-MS/MS). También se han utilizado técnicas de separación como la electroforesis en gel bidimensional, aunque la tendencia actual se orienta hacia métodos basados en MS. El flujo de trabajo típico incluye extracción de proteínas, digestión proteica (habitualmente con tripsina), separación, adquisición de espectros y análisis computacional para identificar proteínas a partir de bases de datos y para cuantificarlas.

La cuantificación puede ser relativa (p. ej., etiquetas SILAC, iTRAQ o TMT) o absoluta, y permite comparar perfiles proteómicos entre condiciones diferentes. El estudio de modificaciones postraduccionales (PTMs) a gran escala, como fosforilación, ubiquitinación o glycosilación, es una faceta clave de la proteómica moderna.

Aplicaciones: descubrimiento de biomarcadores, comprensión de mecanismos de enfermedad, identificación de dianas terapéuticas, desarrollo de fármacos, medicina personalizada, y mejoras en biotecnología y agricultura. Los datos generados se comparten en repositorios como PRIDE y proteomeXchange; herramientas bioinformáticas y redes de interacción (p. ej., STRING, Cytoscape) respaldan el análisis. Desafíos: complejidad del proteoma, rango dinámico de abundancias, reproducibilidad y estandarización de métodos.