Variantenauflösung

Variantenauflösung bezeichnet den Prozess, unterschiedliche Varianten eines Merkmals, Signals oder Datensatzes zu identifizieren, zu isolieren und eindeutig zuzuordnen. Der Begriff wird in verschiedenen Disziplinen verwendet, wobei das Ziel allgemein darin besteht, aus gemischten oder widersprüchlichen Informationen eine konsistente, interpretierbare Repräsentation zu gewinnen.

In der Genomik bzw. Sequenzierung bezieht sich Variantenauflösung auf das Unterscheiden echter genetischer Varianten von Sequenzierungsfehlern und das Zuordnen von Varianten zu den entsprechenden Haplotypen oder Allelen. Sie umfasst Phasing, die Rekonstruktion von Haplotypen sowie die Bestimmung der genetischen Konstellationen in individuellen Genomen. Fortschritte in Long-Read-Technologien verbessern die Auflösung, während statistische Modelle Unsicherheiten berücksichtigen.

Im Bereich der Text- oder Digitalen Geisteswissenschaften kann Variantenauflösung die Normalisierung oder Rekonstruktion variierender Textformen betreffen. Manuskriptvarianten, Editionsunterschiede oder orthografische Varianten werden verglichen, um eine kanonische Lesung, eine rekonstruierte Ursprungsversion oder eine konsistente Datenbasis zu erstellen.

Auch in der Informatik und dem Datenmanagement spielt Variantenauflösung eine Rolle, etwa bei Produkt- oder Datenversionen. Konflikte in Attributen, Duplikate oder uneinheitliche Bezeichner sollen aufgelöst werden, damit aus mehreren Varianten eine klare, konsolidierte Repräsentation entsteht.

Methodisch kommen statistische Modelle, Deconvolution-Verfahren, graphbasierte Ansätze sowie Phasing- bzw. Haplotyp-Tools zum Einsatz. Die Wahl der Methode hängt vom Datentyp, der verfügbaren Information und dem angestrebten Detailniveau ab.