LongReadTechnologien
LongReadTechnologien bezeichnet Sequenzierverfahren, die einzelne Nukleotidstränge über lange Abschnitte lesen. In der Genomik bilden sie die Third-Generation-Sequenzierung und ergänzen Kurzread-Ansätze durch längere Reads sowie neue Analyse- und Phasing-Möglichkeiten.
Zu den führenden Technologien gehören PacBio SMRT-Sequencing und Oxford Nanopore Sequencing. PacBio verwendet Single Molecule Real-Time
Anwendungen umfassen De-novo-Genome-Assembly, Erkennung struktureller Varianten, Phasing und Haplotypisierung, sowie Transkriptom-Studien mit Isoform-Sequenzierung (Iso-Seq). In der
Herausforderungen sind höhere Kosten pro Basispaar, variierender Durchsatz, Anforderungen an hochwertige Proben sowie erhöhter Rechenaufwand und