SplicingVarianten

SplicingVarianten, oft als alternative Splicing-Varianten bezeichnet, entstehen durch das alternative Spleißen der prä-mRNA. Aus einem einzigen Gen können so mehrere unterschiedliche mRNA-Transkripte und damit verschiedene Protein- oder RNA-Isoformen erzeugt werden. Diese Diversität trägt wesentlich zur Proteom-Komplexität bei, ohne die Genomgröße zu erhöhen. In Eukaryoten ist das Spleißen ein zentraler Schritt der RNA-Verarbeitung, der durch das Spliceosom und Hilfsproteine gesteuert wird.

Zu den häufigsten Spleißformen gehören das Exon-Skipping, die Alternative 5'- oder 3'-Spaltungsstellen, Intronretention und subexonale Alternativen wie das gegenseitige Ausschließen von Exons. Zusätzlich können wechselnde Promotoren oder Polyadenylationssignale zu verschiedenen Transkriptstart- oder Transkriptendpunkten führen, was Unterschiede in UTRs und Regulierung ermöglicht.

Splicingvarianten können Proteine mit unterschiedlichen Domänen, Subzellulär-Lokalisierungen oder Interaktionsprofilen erzeugen. Manche Varianten codieren funktionell verschiedene Proteine, andere erzeugen nichtkodierende RNAs, die durch Nonsense-mediated decay degradiert oder als regulatorische RNAs eingesetzt werden. Fehlregulation von Spleißen ist mit Krankheiten assoziiert, darunter Krebs, neurodegenerative Erkrankungen und genetische Störungen.

Die Identifikation erfolgt primär durch Hochdurchsatz-RNA-Sequenzierung (RNA-Seq), ergänzt durch RT-PCR, qPCR und Langlese-Sequenzierung (Long-Read-Sequencing). Beispiele für bekannte Splicingvarianten sind unterschiedliche Isoformen des Gens MAPT (Tau) sowie isoformale Varianten des Gens BCL2L1 (Bcl-x), die unterschiedliche Apoptose-Eigenschaften beeinflussen.