SpliceVerluste

SpliceVerluste bezeichnet in der Molekulargenetik einen Verlust an Splicing-Effizienz oder -Genauigkeit, der zu einer Abnahme korrekt gespleißter mRNA-Transkripte und zu vermehrten fehlerhaften Spleißformen führt. Der Begriff wird in deutschsprachigen Publikationen verwendet, um Phänomene zu beschreiben, bei denen die Splicing-Dichte eines Gens herabgesetzt ist oder Spleißstellen vermehrt missglücken.

Ursachen umfassen Mutationen an Splice-Donor- oder -Akzeptorstellen, Branch-Punkt-Sequenzen sowie an Exon- oder Intron-Silencern/Enhancern. Veränderungen der Splicing-Faktoren (z. B. SR-Proteine, hnRNPs), epigenetische Modifikationen, veränderte Transkriptionsgeschwindigkeit und RNA-Struktur können ebenfalls zu SpliceVerlusten beitragen. Umweltfaktoren und Alterung werden als Einflussfaktoren diskutiert.

Nachweise erfolgen primär durch Transcriptome-Analysen: RNA-Sequenzierung mit Berechnung von PSI-Werten, RT-PCR-Tests, Minigene-Assays und gegebenenfalls Langzeit- oder Einzelmolekül-Sequenzierung, um alternative Spliceformen zu identifizieren.

Folgen der SpliceVerluste sind häufig der Entzug funktioneller Proteinvarianten, die Entstehung von krankheitsrelevanten Isoformen oder der Abbau der Transkripte durch Nonsense-mediated decay. Auf diese Weise können SpliceVerluste die Genexpression eines Gens und dessen Phänotyp beeinflussen.

In der Forschung und Biotechnologie werden Strategien zur Modulation des Splicings genutzt, beispielsweise Splice-switching-Oligonukleotide oder CRISPR-basierte Ansätze, um Splicing-Muster gezielt zu verändern. Der Begriff dient damit als Oberbegriff für Phänomene der Splicing-Fehler und deren biologische Bedeutung.