kärnkomplex

Kärnkomplex är stora makromolekylära sammansättningar som verkar i cellkärnan och är centrala för processer som genuttryck, kromatinorganisation, DNA-reparation och RNA-sprocessing. De består av flera proteiner och ibland RNA, och deras sammansättning kan vara dynamisk och omorganiseras beroende på cellens tillstånd.

Exempel på kärnkomplex inkluderar kärnporkomplexet (nuclear pore complex, NPC), som sträcker sig genom kärnmembranet och reglerar trafiken mellan kärnan och cytoplasman. NPC består av cirka 30 olika nucleoporiner och bildar en central kanal med FG-repeats som fungerar som en selektiv barrier.

Kromatinremodellerande och modifierande komplex, som SWI/SNF, ISWI, INO80 och NuRD, reorganiserar nucleosomer för att reglera tillgången till genetisk information. Transkriptionsmaskineri och koaktivatorer som Mediator och TFIID verkar tillsammans för att rekrytera RNA-polymeras II till promoters och initiera transkription.

RNA-processerings- och exportmaskiner inkluderar spliceosomen och exon-junction-komplexet samt kapsning-, polyadenylerings- och mRNA-exportprocesser inom kärnan. DNA-replikations- och reparationskomplex, exempelvis ORC, MCM-helikas och MRN-/BRCA1-relaterade maskiner, koordinerar kopiering av genomet och dess underhåll.

Betydelse: kärnkomplex möjliggör reglerad genuttryck, RNA-mognad och genomstabilitet. Dysfunktioner kopplas till utveckling, åldrande och sjukdomar som cancer. Forskning använder strukturella metoder som cryo-EM samt livscellsbilder och proteomik för att kartlägga deras sammansättning, arkitektur och dynamik. Etymologi: kärn betyder nucleus eller kärna; komplex betyder complex. Se även kärnporkomplex.