Kromatinremodellerande

Kromatinremodellerande avser processen där ATP-beroende proteinkomplex ändrar kromatinstrukturen för att reglera tillgången till DNA. Genom att påverka hur DNA är packat runt histonerna kan cellen antingen göra specifika genregioner mer tillgängliga för transkriptionsmaskinerna eller mer avstängda. Denna reglering är central för kontrollen av genuttryck, replikation och DNA-reparation i eukaryoter.

Mechanismerna innefattar remodelerande motorer som binder till nucleosomer och använder energin från ATP-hydrolys för att flytta, evikta eller byta ut histonernas positioner och konformationer. Resultatet kan vara slidning av nukleosomer längs DNA, avlägsnande av histon-/nukleosomstrukturer eller utbyte av histonvarianter såsom H2A/H2B-dimerer. Remodellerande aktiviteter fungerar ofta i samverkan med andra kärnelement inom kromatin, inklusive histone-modifierande enzymer och DNA-bindande faktorer.

Företeckningar om familjer och komplex: de flesta kromatinremodellerande proteiner tillhör SNF2-familjen och ingår i större multiproteinkomplex. De fyra huvudsakliga familjerna är SWI/SNF, ISWI, CHD och INO80, var och en med olika mål och rekryteringsmekanismer. Dessa komplex påverkar funktioner som promotor-/ enhancerreglering, nucleosomsliding vid starten av transkription, rekrytering av replikations- och reparationsmaskiner samt kromatinomstruktur under celldifferentiering.

Reglering och betydelse: aktiveringen eller hämningen av kromatinremodellering regleras av transkriptionsfaktorer, histonmodifierare och icke-kodande RNA. Förändringar i remodellerande aktivitet är kopplade till utvecklingsprocesser och olika sjukdomstillstånd, inklusive cancer där vissa SWI/SNF-komplexkomponenter ofta är muterade eller nedreglerade.