Uttrycksnivåer
Uttrycksnivåer beskriver hur mycket av ett specifikt genetiskt material, vanligtvis mRNA eller protein, som produceras i en cell eller vävnad vid en viss tidpunkt. I forskning används termen ofta för att beskriva transkriptionell aktivitet (mRNA-nivåer) samt den efterföljande translationen och proteinnivåer. Skillnaden mellan transkriptions- och proteinnivåer kan ge insikt om posttranskriptionell och posttranslationell reglering.
Mätmetoder för uttrycksnivåer inkluderar kvantitativ PCR (qPCR) för specifika mål, RNA-sekvensering (RNA-seq) för bred övervakning av
Enheter och tolkning av data varierar: RNA-seq uttryck mäts ofta i TPM eller FPKM och jämförs sedan
Faktorer som påverkar uttrycksnivåer är vävnadstyp, utvecklingsstadium, miljö, sjukdomstillstånd, läkemedelsbehandling samt genetiska och epigenetiska skillnader. Tolkningsmässigt
Användningsområden inkluderar grundforskning, biomarkörsundersökningar, diagnostik och läkemedelsutveckling. Begränsningar består av teknisk variation, plattformsberoende skillnader och behovet