Begleitmikroflora

Begleitmikroflora bezeichnet in der Mikrobiologie die Gesamtheit der Mikroorganismen, die in einem bestimmten Lebensraum oder in Verbindung mit einem Wirt gemeinsam auftreten und somit ein Ökosystem bilden, das den Primärorganismus oder den Zielbereich begleitet. Sie umfasst sowohl kommensale als auch mutualistische Arten sowie Umweltmikroben, die in derselben Nische vorkommen. Der Begriff findet in unterschiedlichen Kontexten Anwendung, etwa in der klinischen Mikrobiologie, der Pflanzenpathologie, der Lebensmittelfermentation oder der Umweltmikrobiologie.

Aufbau und Dynamik der Begleitmikroflora sind stark von dem jeweiligen Habitat abhängig. Die Zusammensetzung variiert mit anatomischer Nische, Alter, Ernährung, Gesundheitszustand, Medikamenteneinfluss (z. B. Antibiotika) und Umweltbedingungen. Häufig existieren komplexe Interaktionen zwischen Begleitmikroflora und dem primären Organismus, einschließlich Konkurrenz, syntropher Beziehungen und metabolischer Abhängigkeiten. Der Einfluss kann positiv, neutral oder auch negativ in Bezug auf das Ökosystem oder die Gesundheit des Wirts sein.

Funktionen und Auswirkungen umfassen Kolonisationsresistenz gegenüber Pathogenen, Bereitstellung von Metaboliten durch Kreuzfermentierung und Beeinflussung des Immunsystems. In der Landwirtschaft, der Medizin und der Lebensmitteltechnik ist das Verständnis der Begleitmikroflora wichtig, da sie Wachstum, Vermehrung und Auswirkung von Schlüsselorganismen mitbestimmt.

Nachweis und Abgrenzung erfolgen durch kulturabhängige Methoden sowie kulturunabhängige Ansätze wie 16S-rRNA-Sequenzierung, Metagenomik oder Gammastration. Die Begleitmikroflora wird oft mit der Gesamtmikrobiota überlappend verwendet; in vielen Fällen entspricht sie dem breiteren Begriff der Mikroflora oder Mikrobiota, wobei der Fokus auf Begleit- und Interaktionsaspekten liegt.