vevsspesifitet

Vävnadspecificitet, ofta kallad vevsspesifitet i vardagligt tal, är ett begrepp inom molekylärbiologi som beskriver hur uttrycket av gener varierar mellan olika vävnader och celltyper. Vissa gener uppvisar bredt uttryck över flera vävnader (så kallade housekeeping-gener), medan andra är starkt vävnads-specifika och uttrycks främst i en eller några få vävnader. Vävnadspecificitet är central för att förstå cellers funktion och hur organismers fysiologi upprätthålls och regleras.

Mätningar och data: I moderna studier kartläggs vävnadsuttryck med tekniker som RNA-sekvensering och mikroarray över många vävnader. Ett vanligt mått är tau-indexet, som varierar mellan 0 (uttryckt jämnt över vävnader) och 1 (mycket vävnadsspecifikt). Andra mått används också, exempelvis olika uttrycksprofiler och Gini-koefficienter. Data tillhandahålls av projekt som GTEx, ENCODE och The Human Protein Atlas, vilka sammanställer uttryck över många vävnader och celltyper.

Reglering: Vävnadsspecifikt uttryck uppkommer genom reglering på flera nivåer. Transkriptionsfaktorer, promotorer och enhancers som är aktiva i specifika vävnader styr transkriptionen, medan epigenetiska mekanismer som DNA-metylering och histonmodifieringar bidrar till att öppna eller stänga kromatinet i olika celltyper. Samverkan mellan dessa mekanismer bestämmer när och var ett gene uttrycks.

Betydelse: Vävnadspecificitet är avgörande för normal utveckling, vävnadsspecifika funktioner och anpassning till fysiologiska signaler. Den har klinisk betydelse för biomarkörer och läkemedel där hög vävnadsspecificitet kan minska oönskade biverkningar. Evolutionärt påverkas vävnadsbegränsningar av förändringar i regulatoriska element som följer organismens behov. Se även vävnadsuttryck, housekeeping-gener och genreglering.