konformergenerering
Konformergenerering er en metode inden for beregningskemi, der producerer plausible 3D-organisationer af et molekyle, kaldet konformere. Ved at rotere omkring enkeltbindinger og andre fleksible dele kan man udforske konformationsrummet og få en række mulige geometriske tilstande, som molekylet kan indtage under forskellige betingelser.
Tilgangene kan være systematiske, hvor alle rotatable bindinger dihedrale vinkler udforskes, eller stokastiske, hvor konformationer genereres
Output består af et sæt konformere sammen med tilhørende energiestimater. Energi kan beregnes med forskellige kraftfelter
Anvendelser inkluderer lægemiddeludvikling, QSAR og materialevidenskab. Mange softwarepakker tilbyder konformergenerering, herunder RDKit (ETKDG), Open Babel, OpenEye