bisulfiittisekvensoinnilla
Bisulfiittisekvensointi (bisulfiittisekvensoinnilla) onDNA-metylaation kartoitukseen käytetty menetelmä, jolla voidaan määrittää, ovatko yksittäiset sytosiiniset bases metyloituneet vai eivät. Bisulfiittikäsittelyn aikana epämetyloidut cytosiinit muuttuvat urasileiksi, ja tämän seurauksena sekvensioinnissa niille kohdille luetaan T (tymiini). Metyloituneet cytosiinit pysyvät cytosiineina. Näin voidaan erottaa metyloituneet ja epämetyloidit cytosiinit samalla genomin tai sen osan tasolla.
Työnkulku etenee yleensä siten, että DNA eristetään näytteestä ja altistetaan natriumbisulfiitille, joka muuttaa epämetyloidit cytosiinit. Tämän
Variaatiot ja sovellukset kattavat: whole-genome bisulfite sequencing (WGBS), reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) sekä kohdennettu bisulfite-sekvensointi,
Rajoitukset liittyvät käsittelyn DNA-hajoamiseen, konversiokonversion epävarmuuksiin sekä mahdolliseen epätasaiseen konversioon. Tarvitaan hallitut kontrollit ja asianmukainen analyysimenetelmä,