Sec61komplexet

Sec61komplexet, ofta kallat translocon, är den centrala proteinkanalen i endoplasmatiskt retikelum (ER) som möjliggör translocation av nascenta polypeptider över ER-membranet och insertion av vissa membranproteiner i membranet. Kanalen är avgörande för bildandet av det sekretoriska och membranbundna proteom som följer olika vägförlopp inom cellen.

Sammansättning och struktur: Sec61komplexet är en konservativ heterotrimer som i eukaryoter består av Sec61α, Sec61β och Sec61γ. Sec61α utgör kanalens kärna och bildar den centrala pore som är kontrollerad av en “Lås/plug”-struktur. Sec61β och Sec61γ fungerar som regulatoriska och stabiliserande komponenter. I människan finns flera genevarianter av Sec61α (exempelvis SEC61A1 och SEC61A2) samt SEC61B och SEC61G som kompletterar komplexet. Kanalen är plastiskt inkapslad i ER-membranet och har en lateral gate som gör att hydrophoba segments av polypeptiden kan integreras i membranet.

Funktion och mekanism: Sec61–kanalen binder ribosomen under translationen av sekretoriska proteiner och möjliggör co‑translational translocation genom att polypeptiden passeras genom kanalen in i ER-lumen. Kanalen kan även fungera som en väg för post‑translational translocation i närvaro av hjälpproteiner som Sec62/63 och TRAP-komplexet. När translocationen krävs öppnas kanalen och segment av polypeptiden kan integreras i ER-membranet via den lateral gate. BiP och andra ER-lumenproteiner hjälper till att dra polypeptiden genom och säkerställa korrekt proteinveckning.

evolution och jämförbarhet: Sec61 är den eukaryota motsvarigheten till bakteriella SecYEG och delar en grundläggande mekanism för polypeptidtranslokation över membran. Betydelse: Sec61komplexet är avgörande för biogenesen av sekretoriska proteiner och membranproteiner; störningar i denna process kan orsaka ER-stress och bidra till sjukdomstillstånd.