Rekombinationsmarker

Rekombinationsmarker bezeichnet in der Molekularbiologie und Genetik einen genetischen Marker, der verwendet wird, um Rekombinationsereignisse zu erkennen, zu kennzeichnen oder zu selektieren. Sie dienen dazu, das stattfindende Rekombinationsereignis sichtbar zu machen, z. B. durch Aktivierung eines Reporter-Gens oder durch den Verlust bzw. die Modifikation eines selektierbaren Markers. Rekombinationsmarker können in DNA-Konstrukten eingebaut sein, die eine Funktion erst nach einer Rekombination tragen, oder Marker, die durch eine Rekombination ausgeschaltet oder entfernt werden.

Typen von Rekombinationsmarkern umfassen positive Marker, die nach Rekombination eine neue Funktion übernehmen oder wiederherstellen, sowie counter-selectable Marker, die eine Selektion anhand des Rekombinationsstatus ermöglichen. Häufig erfolgen Rekombinationen über spezialisierte Enzym-Systeme wie site-specific recombinases (zum Beispiel Cre-loxP, FLP-FRT). Dabei kann ein Stoppsignal, ein Reporter-Gen oder eine antibioticum-resistente Gene durch Rekombination aktiviert, deaktiviert oder entfernt werden. Der beobachtbare Output (z. B. Fluoreszenz, Enzymaktivität) dient als Indikator für das Rekombinationsereignis.

Anwendungen finden sich besonders in der Genetik, der funktionellen Genomik, der Erstellung bedingter Knockout-Modelle, der Genetik von Modellorganismen sowie in Linientrailings und Gen-Tagging-Experimenten. Rekombinationsmarker helfen, Rekombinationseffizienz zu messen, Ergebnisse zu validieren und gezielt genetische Veränderungen zu kontrollieren.

Zu den Vorteilen zählen präzise Nachweisbarkeit und die Möglichkeit, Rekombinationen räumlich oder zeitlich zu steuern. Zu den Einschränkungen gehören Hintergrundaktivität, mögliche Auswirkungen des Markers auf das Genom sowie Unterschiede in der Effizienz zwischen Systemen und Organismen. See also: genetischer Marker, site-specific recombination, Reporter-Gene, bedingte Knockouts.