Enhancersekvensen

Enhancersekvensen, den engelska termen enhancer sequence, är en cis-regulatorisk DNA-sekvens som ökar transkriptionen av en målgen när den är närvarande i närheten av promotorregionen. Den kan ligga långt från promotoren eller inom intron och verkar ofta oberoende av orientering och avståndet till genen. Funktionen beror på att den binder transkriptionsfaktorer och främjar rekrytering av samverkande proteiner.

Mekanismen innebär att enhancersekvensen bildar DNA–proteinloopar som kopplar sig till promotoren via mediator- och coactivator-komplex, vilket ökar RNA-polymeras II-initiationen. Aktiviteten är ofta cellspecifik och utvecklingsreglerad, vilket gör att samma enhancersekvens kan reglera olika gener i olika vävnader.

Upptäckt och kartläggning görs ofta med epigenetiska markörer och kromatinåtkomststudier. Typiska tecken är histonmarkörerna H3K4me1 och H3K27ac samt ATAC-seq eller DNase I-hypersensitivity. Funktioner kan bedömas i reporterassays, medan CRISPR-baserade perturbationer används för att studera effekter i celler eller organismer.

Betydelse och exempel: enhancersekvenser är centrala för utveckling och celltypsspecifik reglering. Mutationer eller variationer i dessa sekvenser kopplas till olika sjukdomstillstånd genom felaktig genreglering. En klassisk exemplifiering är SHH-limbregulatorn ZRS, en långt belägen enhancersekvens som reglerar Sonic hedgehog-uttryck i limbutvecklingen. Evolutionärt bidrar variation i enhancersekvenser till arter och fenotypskillnader.