Endopeptidaasit
Endopeptidaasit ovat proteolyyttisiä entsyymejä, jotka katalysoivat peptidisidosten hydrolyysi proteiiniketjujen sisäosissa. Tämä eroaa exopeptidaaseista, jotka leikkaavat vain proteiinien päitä. Endopeptidaasit jaetaan mekanismin mukaan neljään pääryhmään: seriiniproteaasit, kysteiiniproteaasit, aspartaatiin-proteaasit ja metalloproteaasit. Esimerkkejä ovat seriiniproteaasit trypsiini, chymotrypsiini ja elastaasit, joiden aktiivisen keskuksen muodostaa usein triadi Ser-His-Asp; kysteiiniproteaasit kuten papaiini sekä kaspases; aspartaatti-proteaasit kuten pepsiini; sekä metalloproteaasit kuten matrix metalloproteinaasit (MMP:t), jotka tarvitsevat sinkkiä.
Endopeptidaasit suorittavat monia tärkeitä tehtäviä eri biologisissa prosesseissa. Ruoansulatuskanavassa ne pilkkovat ruokamolekyylien proteiineja; lysosomaalisessa proteolyysissä ne
Sääntely ja kliininen merkitys: proteaasien aktiivisuutta kontrolloivat inhibiittorit, kuten serpins seriiniproteaasien säätelyssä sekä TIMPit metalloproteinaaseja vastaan.