- Oksidatiiviset desinfektioaineet: kloori- ja klooriyhdisteet (esimerkiksi natriumhypokloriitti) sekä vetyperoksidi ja perakihappoon perustuvat valmisteet. Ne vapauttavat hapen avulla mikrobien soluja vahingoittavia reaktiivisia aineita, ja ovat laaja-alaisia sekä bakteereja että viruksia vastaan.
- Kationiset ammonium-yhdisteet (QAC:t): benzalkoniumkloridi ja muut vastaavat yhdisteet. Terveellisiin käytön kohteisiin liittyvät pintojen puhdistukseen ja hajujen vähentämiseen, mutta ne voivat olla rajoitetumpia sporeja vastaan.
- Alkoholihajoittajat: etanoli ja isopropanoli, yleisiä sekä pintojen että käsien desinfektiossa. Nopea vaikutus, mutta eivät aina sporeja tuhoavia.
- Aldehidit: glutaraldehydi ja formaldehydi, voimakkaita desinfektioaineita käytössä erityisesti lääke- ja välinehuollossa, mutta korkea toksisuus ja säilytysrajoitukset.
- Biguanidit: klorheksidiini on yleinen desinfektio- ja antiseptinen aine, laajakirjoisen mikrobien torjunnan lisäksi käytetty sairaalaympäristöissä.
- Happoja/hapettavia yhdisteitä: peräkkäiset hapetuslaitteet kuten perasetaattihappo, käytetään korkeatasoisessa desinfioinnissa ja steriloinnissa, mutta voivat olla korrosoivia.
Desinfektioaineita käytetään terveydenhuollossa, laboratorioissa, elintarviketeollisuudessa, vesihuollossa sekä kotitalouksissa pintojen, välineiden ja tilojen desinfektioon. Käyttö riippuu aineen laajasta spektristä, kontaktiajasta ja soveltuvuudesta kyseiseen pintaan tai välineeseen.
Desinfektioaineet voivat olla ärsyttäviä tai myrkyllisiä ja ne on käsiteltävä ohjeiden mukaan, suojavarustein sekä asianmukaisessa ilmanvaihdossa. Yhteensopivuus muiden kemikaalien kanssa on tärkeää, sillä esimerkiksi kloorivalmisteiden ja ammonniyaineiden sekoittaminen voi aiheuttaa vaarallisia reaktioita. Käyttö- ja varastointiohjeet sekä voimassa olevat säännökset (esimerkiksi EU:n biocidiliikeja BPR sekä Yhdysvaltain EPA) määrittävät hyväksyttävät aineet ja tuotteiden merkinnät, mukaan lukien kontakti-ajat ja pitoisuudet. Desinfektioaineiden ympäristövaikutukset huomioidaan myös käytönaikaisesti sekä jätehuollossa.