polypeptidkjede

En polypeptidkjede er en lineær kjede av aminosyrer som er koblet sammen med peptidbindinger. Peptidbindingen dannes i en kondensasjonsreaksjon mellom aminogruppen hos én aminosyre og karboksylgruppen hos neste, og et molekyl vann fjernes som biprodukt. Sekvensen av aminosyrer bestemmer kjedens kjemiske egenskaper og hvordan den kan foldes og fungere.

Den lineære kjeden utgjør primærstrukturen, og retningen går vanligvis fra N-terminus til C-terminus. Avhengig av sekvens og miljø kan polypeptidkjeden være del av et protein eller fungere som et fritt peptid. Lengden varierer fra noen få aminosyrer til flere tusen.

Gjennom folding kan polypeptidkjeden danne sekundærstrukturer som alpha-helix eller beta-pleated sheet, stabilisert av hydrogenbindinger mellom aminosyrer. Videre folding fører til tertiærstruktur og i noen tilfeller kvartærstruktur når flere polypeptidkjeder samhandler i et proteinkompleks. Stabiliteten påvirkes av hydrofobe interaksjoner, ionebindinger, hydrogenbindinger og disulfidbroer mellom cysteinrester.

Funksjonelt er mange polypeptidkjeder byggesteiner i proteiner. Noen kjeder fungerer som små peptider med egne biologiske aktiviteter, for eksempel som hormoner eller signalmolekyler. De fleste polypeptidkjeder syntetiseres av ribosomer gjennom translasjon av mRNA og kan gjennomgå post-translasjonelle modifikasjoner som glycosylering eller fosforylering.

Forandringer i polypeptidkjeder kan påvirke folding og funksjon og er sentrale i mange biologiske prosesser og sykdommer.