nukleosomeihin

Nukleosomit ovat eukaryoottisen kromatiinin perusyksiköitä. Ne koostuvat noin 147 pituista DNA:ta, joka kiertyy histonien octameren ympärille. Histonien octamerin muodostavat kaksi H2A-, kaksi H2B-, kaksi H3- ja kaksi H4-histonia. DNA kiertyy näiden histonien ympäri noin 1,65 kierrosta. Nukleosomit ovat vierekkäin linker-DNA:n välityksellä, ja histoni H1 toimii linker-histoneina, joka auttaa stabiloimaan korkeampaa kromatiinikudostumista. Näin muodostuu järjestelmä, jossa DNA on tiivistetty mutta yhä käytettävissä solun toiminnoille.

Toiminta ja dynaaminen säätö: Nukleosomit sekä pakkaavat DNA:ta että säätelevät genien ilmentymistä. Niiden sijoittelu ja tiheys DNA-alueilla vaikuttavat siihen, kuinka helposti tekijät ja muut proteiinit pääsevät DNA:han. Chromatin-remodeling -kompleksit (esim. SWI/SNF, ISWI, CHD, INO80) sekä histonien kantajat voivat siirtää, poistaa tai uudelleen järjestää nukleosomeja, mikä muuttaa alueen aktiivisuutta. Näin solu kykenee säätelemään transkriptio-, replikaatio- ja DNA repair -prosesseja.

Säätely ja tutkimus: Histonien tail-modifikaatiot, kuten asetylaatio, metylaatio, fosforylaatio ja ubiquitylaatio, muodostavat osittain histonien koodin, jolla kromatiinin tilaa säädellään ja proteiinien rekrytointi ohjataan. Nukleosomien asemaa kartoitetaan tutkimuksessa usein MNase-seqillä ja ATAC-seqillä, jotka paljastavat nukleosomien sijainnin sekä kromatiinin käytettävyyden.