RNAsegmentistä

RNAsegmentti tarkoittaa RNA-molekyylin erillistä osaa, jolla on oma geneettinen informaatio. Segmentointi on järjestäytymistapa, jossa viruksen genomi koostuu useammasta erillisestä RNA-pätkästä sen sijaan, että koko genomi olisi yksi pitkä molekyyli. Segmenttien määrä vaihtelee lajin mukaan ja voi olla muutamasta kolmesta aina useampaan kymmeneen.

RNAsegmenttejä esiintyy erityisesti segmentoituneissa RNA-viruksissa. Tunnetuimpia esimerkkejä ovat Orthomyxoviridae-heimon influenssavirukset (8 segmentoita), Reoviridae-heimon rotavirus-virukset sekä muut bunyavireusten ja vastaavien ryhmien segmentoituneet genomit. Segmenttien pituudet ja koodaamat proteiinit vaihtelevat suuresti virustyypin mukaan, mutta usein jokainen segmentti toimii itsenäisenä perimäyksikkönä.

Jokainen RNAsegmentti voi koodata yhden tai useamman proteiinin tai toimia osana suurempaa kokonaisuutta. Segmentit sisältävät sekä koodaavaa aluetta että säätelyalueita, joiden avulla geenejä ilmentää ja viruksen RNA:a käsitellään solussa. Segmenttien pakkaaminen yhteen virioon edellyttää tarkkaa geeniä koskevaa signaalia, jotta kaikki tarvittavat segmentit löytyvät ja toimivat yhdessä.

Reassortment, eli segmenttien vaihtuminen, on keskeinen ilmiö segmentoituneissa viruksissa. Kun solu on infektoitunut kahdella eri segmentoituneella viruksella, uusissa virioneissa voidaan yhdistää kummankin vanhemman segmenttejä. Tämä voi johtaa nopeasti uusiin strainseihin ja vaikuttaa viruskantojen ominaisuuksiin kuten virulenssiin ja immunologiseen reaktimeen.

Tutkimuksessa RNAsegmenttejä erotellaan ja sekvensoidaan, mikä auttaa virusten tunnistuksessa, epidemiologisessa seurannassa ja lääke- sekä rokotepäätösten tukemisessa. Segmenttien tunnistus ja ymmärtäminen on tärkeä osa virustutkimusta ja virologista diagnostiikkaa.