Monibiomeikkojen

Monibiomeikkojen käsite viittaa biomarkkereiden ryhmään, joka perustuu signaaleihin useista ihmiskehon mikrobiomeista. Tällaiset biomarkkerit voivat tarjota kokonaisvaltaisemman kuvan yksilön terveys- tai sairausriskistä kuin perinteiset, yhden mikrobialueen biomarkkerit.

Määritelmä: Monibiomeikko on biomarkkeri tai biomarkkerijoukko, joka syntyy yhdistämällä tietoja useista mikrobiomeista—esimerkiksi suoliston, suun, ihon ja emättimen mikrobien koostumuksesta, toiminnallisista poluista tai metaboliiteista.

Menetelmät: tutkimuksessa kerätään näytteet useista kehon alueista. Sekvensointitekniikat kuten 16S rRNA -tutkimus, kokonaisen genomin metagenomiikka sekä metatranskriptomiikka tuottavat data. Tiedot integroidaan tilastollisin ja koneoppimisin menetelmin tunnistetun biomarkkeriryhmän muodostamiseksi.

Käyttökohteet: monibiomeikkoja voidaan tarkastella terveyden seurannassa, sairauksien riskin ennustamisessa ja hoitovasteen arvioinnissa. Esimerkkejä ovat tulehdukselliset tilat, metaboliset oireyhtymät sekä immuunivasteen tutkimukset. Myös populaatio- ja ympäristöterveyden tutkimuksessa voidaan tarkastella useiden mikrobialueiden yhteisvaikutuksia.

Haasteet: standardoinnin puute, kohorttien ja ajallisen vaihtelun huomioiminen sekä näytteiden ja teknologioiden erilaistuminen. Datan integraatio useista mikrobiomeista vaatii erityisiä tilastollisia lähestymistapoja ja tarkkaa tulkintaa.

Historia: Termi on suhteellisen uusi ja vaihtelevasti käytetty; monibiomeikkojen käsite kehittyy osana microbiomitutkimuksen laajempaa trendiä kohti multi-omics- ja järjestelmäbiologiaa.