Genomdrivande

Genomdrivande är ett svenskt adjektiv som används inom biologi och medicin för att beskriva forskning, strategier eller beslut som styrs av information från hela genomet snarare än av enstaka gener eller målområden. Begreppet används ofta i samband med helgenom- eller exomsekvensering samt integrerade analyser av genomiska data.

Genomdrivna angreppssätt syftar till att fånga variationer i kodande och icke-kodande regioner, strukturella variationer och regulatoriska element över hela genomet, vilket möjliggör bredare insikter än målbaserade metoder. Inom klinisk forskning och vård används de inom precision medicine och cancergenomik för att identifiera mutationen eller mönster som kan vägleda behandling, prognostik eller riskbedömning. Inom jordbruk och industriell bioteknik används genomdrivna strategier för att förstå genetiska egenskaper hos organismer och optimera egenskaper som avkastning, motståndskraft eller produktionsflöden.

Metoder som ofta ingår är helgenomsekvensering, helgenomavbildning och integrerade dataanalyser där genomsnitt, epigenetik, transkriptom och proteom kombineras med kliniska eller beteendemässiga data. Det innebär ofta omfattande bioinformatiska analyser och samarbete mellan kliniska specialister, forskare och teknikexperter.

Fördelar med genomdrivna tillvägagångssätt inkluderar en mer heltäckande bild av genetiska faktorer, upptäckt av ovanliga eller icke-kodande variationer och större potential för individanpassade beslut. Utmaningar består i hög kostnad, komplex datahantering, tolkning av variationer med osäker betydelse samt frågor om integritet och dataskydd.

Relaterade begrepp innefattar genomik och precision medicine, där målet är att använda komplett genetisk information för bättre förståelse och vård.