Cterminalen

Cterminalen, eller C-terminusen, är änden av en polypeptidkedja som bär den fria karboxylgruppen. Den ligger i motsats till N-terminusen, som har den fria aminogruppen. I färdiga proteiner kan C-terminalen vara platsen för posttranslationella modifieringar, proteolytisk klyvning eller tillägg av kemiska grupper. Den sista aminosyran och dess omgivning påverkar proteinets egenskaper och funktion.

Funktion och betydelse. Sekvensen runt C-terminalen kan påverka proteinet som helhet när det gäller stabilitet, nedbrytningstid och interaktioner med andra molekyler. Vissa korta C-terminala motiv fungerar som lokalisationssignaler som styr var i cellen proteinet hamnar. Andra C-terminala motiv fungerar som degron-signaler som bidrar till proteinsökning och nedbrytning. C-terminala trima signalsignaler förekommer i vissa organeller, och generellt kan C-terminus påverkas av exopeptidaser såsom karboxypeptidaser som klipper av rester från den fria karboxyländen.

Användning i forskning och bioteknik. Inom rekombinant proteinproduktion används ofta C-terminala fusion-taggar för detektion och rening av proteiner. Sådana taggar kan påverka proteinets funktion och uttryck jämfört med N-terminalt fästa taggar, och valet av placementsort beror på experimentets mål. Inom proteomik analyseras ofta C-terminala peptider för att kartlägga klyvningsställen och terminering av uttryck, exempelvis genom masspektrometri och proteolytisk kartläggning.

Se även. N-terminus, proteinterminer, posttranslationella modifieringar, proteolys.