Bakteeriryhmä

Bakteeriryhmä on käsite, jolla tarkoitetaan bakteerien joukkoa, joka jakaa yhteisiä ominaisuuksia tai kuuluu samaan evolutiiviseen tai taksonomiseen ryhmään. Käytännössä bakteeriryhmä voi viitata sekä suurempiin kokonaisuuksiin, kuten phylumiin, että pienempiin, toiminnallisesti tai geneettisesti määriteltyihin ryhmiin.

Ryhmien määritelmä perustuu sekä geneettisiin että fenotyyppisiin ominaisuuksiin. Keskeisiä työkaluja ovat 16S ribosomaalisen RNA-geenin sekvensointi sekä kokonaisgenomien analyysit, joiden avulla voidaan arvioida sukulaisuussuhteita ja nimetä ryhmiä. Viimeaikaiset luokittelut, kuten Genome Taxonomy Database (GTDB), täydentävät perinteisiä nimityksiä.

Suurempia bakteeriryhmiä ovat esimerkiksi Proteobakteerit (laaja joukko Gram-negatiivisia bakteereita), Firmicutes ja Actinobacteria (Gram-positiiviset bakteerit), sekä Bacteroidota (entinen Bacteroidetes). Muita merkittäviä ryhmiä ovat Cyanobacteria, Spirochaetes ja Chlamydiae. Ryhmäkäsitteet voivat kattaa sekä monimutkaisia ekosysteemejä että yksittäisiä lajeja, ja sisällä bakteerit voivat olla hyvin erilaisia, mutta niillä on yhteisiä evolutiivisia taustoja.

Bakteeriryhmien tuntemus on keskeistä ekologiassa, terveydenhuollossa ja bioteknologiassa. Niiden määrittäminen auttaa ymmärtämään mikrobien roolia ympäristössä, ihmisen ja eläinten terveydessä sekä mahdollistaa mikrobiomien hyödyntämisen diagnostiikassa, ympäristötekniikassa ja teollisissa sovelluksissa.