transposasi

Transposasi adalah pergerakan elemen transposable (TE) di dalam genom, yaitu perpindahan potongan DNA dari satu lokasi ke lokasi lain. Perpindahan ini dapat menghasilkan mutasi, mengubah ekspresi gen, atau membentuk rearrangement genom, sehingga memberikan kontribusi pada variasi dan evolusi genom.

Transposon dibagi menjadi dua kelas utama: transposon DNA dan retrotransposon. Transposon DNA bergerak melalui mekanisme cut-and-paste, biasanya dibantu enzim transposase dan memiliki ujung terbalik (terminal inverted repeats, TIR). Proses ini memotong elemen dan menyisipkannya di lokasi baru, sering disertai duplikasi situs target. Retrotransposon bergerak melalui RNA sebagai intermediary: transkripsi, transkripsi balik menjadi cDNA (reverse transcription), lalu integrasi ke situs baru (copy-and-paste). Retrotransposon dibagi lagi menjadi kelompok berbasis LTR (long terminal repeat) dan non-LTR.

Beberapa contoh elemen transposon meliputi IS elements dan Tc1/mariner, hAT, serta P elements pada serangga dan tanaman. Pada manusia dan vertebrata lain, contoh penting adalah retrotransposon non-LTR seperti LINE-1 (L1) dan SINE seperti Alu, yang dapat berkontribusi pada mutasi dan regulasi gen.

Dampak transposasi pada genom sangat signifikan. Ia dapat memicu mutasi, mengubah regulasi gen, atau memicu replikasi dan struktur genom yang baru. Sebagian elemen transposon juga telah terdomestikasi menjadi bagian dari fungsi inang. Selain perannya dalam penelitian dasar, transposase telah dimanfaatkan sebagai alat bioteknologi, misalnya dalam sistem Sleeping Beauty dan piggyBac untuk penyisipan gen.

Penemuan transposon pertama kali diungkap oleh Barbara McClintock pada jagung, yang menunjukkan pergerakan elemen DNA antar lokasi dan memicu perubahan fenotip. Hal ini membuka pemahaman tentang dinamika genom yang dinamis.