transcriptiofaktoreiden

Transcriptiofaktoreita ovat proteiinit, jotka säätelevät geenien ilmentymistä sitoutumalla spesifisiin DNA-sekvensseihin. Ne toimivat pääasiassa promotorien ja enhanssien alueilla ja vaikuttavat RNA-polymeraasi II:n rekrytointiin sekä aloituskompleksin muodostumiseen. Osa tekijöistä toimii pioneer-faktoreina avaamalla pakkautunutta kromatiinia, jolloin muut tekijät voivat sitoutua.

Faktorit koostuvat yleensä DNA:ta sitovasta DNA-binding-alueesta sekä aktivoiva- tai repressoiva-alueesta. Ne jaetaan yleisiin transkriptiofaktoreihin sekä spesifisiin regulatiivisiin tekijöihin; yleiset tekijät osallistuvat perusaloitukseen kaikissa geeneissä, kun taas spesifiset tekijät ohjaavat yksittäisten geenien ilmentymää solutyyppien ja tilojen mukaan.

Toiminnassaan ne voivat rekrytoida koaktivaatoreita ja korepressoreita sekä Mediator-kompleksia ja kromatiinin remodeloijia. Ne vaikuttavat kromatiinin tilaan histonimuokkauksilla ja DNA-silmukoitumisella etäisiin enhansseihin. Signaalisignaaleista riippuvat modifikaatiot, kuten fosforylaatio tai acetilaation, voivat muuttaa niiden aktiivisuutta sekä aloitussijaintia solussa.

Transkriptiofaktoreilla on keskeinen rooli kehityksessä, solujen erilaistumisessa ja vasteissa sairauksiin. Epäonnistunut säätely voi johtaa kehityshäiriöihin, syöpään ja muihin tiloihin. Esimerkkejä ovat p53, NF-kB, STAT-proteiinit sekä solukontekstiin liittyvät tekijät kuten Oct4, Sox2 ja MyoD.

Tutkimuksessa käytetään menetelmiä kuten ChIP-Seq, EMSA, DNase-footprinting sekä raportorakenteisiin perustuvia kokeita ja ATAC-Seq.

---