proteiiniproteiiniinteraktiomeja

Proteiiniproteiiniinteraktiomeja, eli proteiinien välisiä vuorovaikutuksia, tarkastellaan kattavasti proteiiniproteiini-interaktiomian tutkimusalalla. Tämän alan tavoitteena on selvittää ja kartoittaa kaikki proteiinien väliset vuorovaikutukset solussa tai organismissa. Nämä vuorovaikutukset ovat biologisesti välttämättömiä lähes kaikille solun toiminnoille, mukaan lukien aineenvaihdunta, signaalinvälitys, DNA:n replikaatio ja transkriptio, sekä solun rakenteen ylläpito.

Proteiinien vuorovaikutukset voivat olla fyysisiä sitoutumisia, joissa proteiinit muodostavat stabiileja komplekseja, tai ne voivat olla hetkellisempia, dynaamisempia tapahtumia. Vuorovaikutukset ovat usein spesifisiä ja riippuvaisia proteiinien kolmiulotteisesta rakenteesta ja aminohapposekvensseistä. Ne voivat tapahtua solulimassa, tumassa tai muissa soluelimissä. Proteiinien välisten vuorovaikutusten ymmärtäminen on keskeistä monien sairauksien, kuten syövän ja neurodegeneratiivisten sairauksien, taustalla olevien mekanismien selvittämisessä.

Proteiiniproteiini-interaktiomian tutkimuksessa käytetään monenlaisia kokeellisia menetelmiä. Näitä ovat esimerkiksi hiivasubstraattitestaus (yeast two-hybrid), koimmunopresipitaatio (co-immunoprecipitation) ja massaspektrometria. Lisäksi laskennallisia menetelmiä hyödynnetään ennustamaan potentiaalisia vuorovaikutuksia ja analysoimaan suuria määriä dataa. Interaktiomikansan kartoittaminen auttaa ymmärtämään solun monimutkaisia verkostoja ja löytämään uusia kohteita lääkekehitykselle.