palmitoylaatiota

Palmitoylaatio on proteiinien posttranslatoorinen muokkaus, jossa palmitiinihappo liitetään kovalenttisesti proteiiniin, tyypillisesti cysteiiniresiduunin kautta muodostuvan thioesterisidoksen (S-palmitoylaatio). Prosessi on dynaaminen ja reversiibiliteetti on keskeinen osa sen säätelyä. Palmitoylaation katalysoivat zDHHC-perheen palmitoylaattientsyymit, jotka käyttävät palmitoyyl-CoA:ta siirtääkseen palmitoyyliryhmän kohteeseen. Depalmitoylaatio tapahtuu eräiden acyl-proteiini thioesteraasien (APT1, APT2) sekä ABHD-entsyymien vaikutuksesta, joten muutos on nopeasti säädettävissä solun tilojen mukaan.

Palmitoylaatio vaikuttaa proteiinien membraneihin kiinnittymiseen, alakohtaisiin subcellulaarisiin lokalisaatioihin, vakauteen sekä vuorovaikutuksiin ja signaalin kulkuun. Esimerkkejä on Ras-proteiinien membranipaikan varmistaminen, PSD-95:n synaptiset toiminnot sekä useiden GPCR:ien ja ionkanavien regulointi. Rovitus on tärkeä kehityksessä, aivojen synaptisessa plastisuudessa ja immuunitoiminnassa; virheellinen säätely on yhdistetty moniin sairauksiin, kuten syöpään ja neurodegeneratiivisiin häiriöihin.

Tutkimuksessa palmitoylaatiota eliminoidaan tai paikannetaan käyttämällä acyl-biotin exchange -menetelmää (ABE), acyl-RAC-tekniikkaa sekä metabolisia merkkauksia alkynyl-palmitaattilajeilla (esim. 17-ODYA). Näillä menetelmillä voidaan tunnistaa palmitoylaatiokohteita ja paljastaa muokkauksen dynamiikkaa suhteessa solun tiloihin. Palmitoylaatio on monimutkainen ja nopeasti muuttuva proteiinien posttranslaation muoto, jolla on laaja merkitys solujen toiminnalle.