mikromatriisianalyysillä

Mikromatriisianalyysi, tunnettu myös nimellä mikromatriisidata-analyysi, on tilastollinen menetelmä, jota käytetään laajasti geeniekspressiotutkimuksissa. Se perustuu mikromatriisitekniikkaan, jossa miljoonia DNA- tai RNA-molekyylejä, kuten geenejä tai lyhyitä DNA-fragmentteja, immobilisoidaan kiinteälle alustalle, kuten lasisiruun. Tämän avulla voidaan samanaikaisesti mitata tuhansien tai jopa miljoonien eri geenien aktiivisuutta tai läsnäoloa tietystä biologisesta näytteestä.

Analyysin tavoitteena on tunnistaa ja luokitella erilaisia geenien ilmentymismalleja tai tunnistaa merkittäviä eroja geenien aktiivisuudessa eri näytteiden välillä. Tämä voi auttaa esimerkiksi tunnistamaan sairauksiin liittyviä geenejä, ymmärtämään solujen vasteita lääkkeisiin tai löytämään biomarkkereita sairauksien diagnostiikkaan.

Mikromatriisianalyysi sisältää useita vaiheita, mukaan lukien näytteen valmistelu, datan kerääminen mikromatriisilukijalla, ja monimutkainen tilastollinen analyysi. Tilastolliset menetelmät, kuten pääkomponenttianalyysi (PCA), klusterointi ja differentiaalisen geeniekspression analyysi, ovat keskeisiä datan tulkinnassa. Haasteita analyysissä ovat datan suuri ulottuvuus ja mahdolliset tekniset virheet, jotka vaativat huolellista validointia ja robustia tilastollista mallinnusta.